Josep Lluis Gelpi Buchaca

Catedràtic d'Universitat

ORCID: 0000-0002-0566-7723

Scopus Author ID: 35517522400

Researcher ID: M-6401-2013

Àrea de coneixement : Bioquímica i Biologia Molecular

Grup de Recerca: MODELITZACIÓ MOLECULAR I BIOINFORMÀTICA

Informació de contacte
Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular
C/Diagonal 643
934034009
gelpi(a)ub.edu

Docència

Reponsable linia de Bioinformàtica en el Programa de Doctorat de Biomedicina

Membre de la Comissió acadèmica del Grau interuniversitari de Bioinformàtica

Formació acadèmica

Química . Universidad de Barcelona . 1984 . (Diplomatura / Llicenciatura / Grau)

Química . Universitat de Barcelona . 13/07/1990 . (Doctorat )

Linies de Recerca

Desenvolupament de metodologies de predicció en en reconeixement molecular

Metodologies d'integració de dades biològiques. Bases de dades biològiques

Desenvolupament d'entorns virtuals de recerca

Avaluació de conseqüències funcionals de variants de seqüència

Estudi de la regulació al·lostèrica mitjançant eines de simulació

Projectes

HealthyCloud Health Research & Innovation Cloud (HealthyCloud) . 2021 - 2023 . Ref.965345 . Unió Europea . IP: Karim Lekadir

Training network to advance integrated computational simulations in translational medicine, applied to intervertebral disc degeneration . 2020 - 2024 . Ref.955735 . European Commission . IP: Mariano Vazquez

leveraging the European compute infrastructures for data-intensive research guided by FAIR principles (EuroScienceGateway) . 2022 - 2025 . Ref.101057388 . Unió Europea . IP: Jose Luis Gelpi Buchaca

A European Health Data Toolbox for Enhancing Cardiology Data Interoperability, Reusability and Privacy (DataTools4Heart) . 2022 - 2026 . Ref.101057849 . Unió Europea . IP: Karim Lekadir

European Federation for Cancer Images (EUCAIM) . 2023 - 2026 . Ref.101100633 . Unió Europea . IP: Jose Luis Gelpi Buchaca

Publicacions en revistes

Hospital, A.; Goñi, R.; Orozco, M.; Gelpí, J.L. (2015). Molecular dynamics simulations: advances and applications. Advances and Applications in Bioinformatics and Chemistry, 8, pp. 37 - 47 . https://doi.org/10.2147/AABC.S70333 . ISSN: 1178-6949

ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Consortium: Campbell, PJ; Getz, G; Korbel, JO; Stuart, JM; Jennings, JL; Stein, LD; [...] Rabionet, R; [...] Gelpi, JL; [...] Aymerich, M; Lopez-Guillermo, A; [...] Campo, E; [...] (2020). Pan-cancer analysis of whole genomes. Nature, 578(7793), pp. 82 - 93 . Repositori Institucional . ISSN: 0028-0836

Lamprecht, A-L.; Garcia, L.; Kuzak, M.; Martinez, C.; Arcila, R.; Martin Del Pico, E.; Dominguez Del Angel, V.; van de Sandt, S.; Ison, J.; Martinez, P. A.; McQuilton, P.; Valencia, A.; Harrow, J.; Psomopoulos, F.; Gelpi, J.Ll.; Chue Hong, N.; Goble, C.; Capella-Gutierrez, S. (2019). Towards FAIR principles for research software. Data Science . https://doi.org/10.3233/DS-190026 . ISSN: 2451-8484

Buitrago, D.; Codó, L.; Illa, R.; De Jorge, P.; Battistini, F.; Flores, O.; Bayarri, G.; Royo, R.; Del Pino, M.; Heath, S.; Hospital, A.; Gelpí, J.L.; BrunHeath, I.; Orozco, M. (2019). Nucleosome Dynamics: A new tool for the dynamic analysis of nucleosome positioning. Nucleic Acids Research, 47, pp. 9511 - 9523 . Repositori Institucional . ISSN: 0305-1048

Hospital, A.; Battistini, F.; Soliva, R.; Gelpi, J.L.; Orozco,M. (2019). Surviving the deluge of biosimulation data. WIREs Computational Molecular Science, e1449 . https://doi.org/10.1002/wcms.1449 . ISSN: 1759-0876

Sati, S.; Bonev, B.; Szabo, Q.; Jost, D.; Bensadoun, P.; Serra, F.; Loubiere, V.; Papadopoulos, G.L.; Rivera-Mulia, J.C.; Frisch, L.; Bouret, P.; Castillo, D.; Gelpi, J.L.; Orozco, M.; Vaillant, C.; Pellestor, f.; Bantignies, F.; Marti-Renom, M.A.; Gilbert, D.M.; Lemaitre, J.M. and Cavalli, G. (2020). 4D Genome rewiring during oncogene-induced and replicative senescende. Molecular Cell, 78(3), pp. 522 - 538 . Repositori Institucional . ISSN: 1097-2765

Bayarri, G.; Andrio, P.; Hospital, A.; Orozco, M. and Gelpi, J.L. (2022). BioExcel Building Blocks REST API (BioBB REST API). Bioinformatics, 38, pp. 3302 - 3303 . https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac316 . ISSN: 1367-4803

Nadeu, F.; Royo, R.; Massoni-Badosa, R.; Playa-Albinyana, H.; Garcia-Torre, B.; Duran-Ferrer, M.; Dawson, K.J.; Kulis, M.; Diaz-Navarro, A.; Villamor, N.; Melero, J.L.; Chapaprieta, V.; Dueso-Barroso, A.; Delgado, J.; Moia, R.; Ruiz-Gil, S.; Marchese, D.; Giró, A.; Verdaguer-Dot, N.; Romo, M.; Clot, G.; Rozman, M.; Frigola, G.; Rivas-Delgado, A.; Baumann, T.; Alcoceba, M.; González, M.; Climent, F.; Abrisqueta, P.; Castellví, J.; Bosch, F.; Aymerich, M.; Enjuanes, A.; Ruiz-Gaspà, S.; López-Guillermo, A.; Jares, P.; Beà, S.; Capella-Gutierrez, S.; Gelpí, J.L.; López-Bigas, N.; Torrents, D.; Campbell, P.J.; Gut, I.; Rossi, D.; Gaidano, G.; Puente, X.S.; Garcia-Roves, P.M.; Colomer, D.; Heyn, H.; Maura, F.; Martín-Subero, J.I.; Campo, E. (2022). Detection of early seeding of Richter transformation in chronic lymphocytic leukemia. Nature Medicine . https://doi.org/10.1038/s41591-022-01927-8 . ISSN: 1078-8956

Bayarri, G.; Andrio, P.; Hospital, A.; Orozco, M. and Gelpí, J.L. (2022). BioExcel Building Blocks Workflows (BioBB-Wfs), an integrated web-based plartform for biomolecular simulations. Nucleic Acids Research, 50(W1), pp. W99 - W107 . Repositori Institucional . ISSN: 0305-1048

Yakneen, S; Waszak, SM; PCAWG Technical Working Group; Gertz, M; Korbel, JO; PCAWG Consortium (2020). Butler enables rapid cloud-based analysis of thousands of human genomes. Nature Biotechnology, 38, pp. 288 - 292 . Repositori Institucional . ISSN: 1087-0156

Altres Publicacions

Sfriso, P.; Emperador, A.; Gelpí, J.L.; Orozco, M. (2014). Discrete Molecular Dynamics . En Computational Approaches to Protein Dynamics: From Quantum to Coarse-Grained Methods . (pp. 339 - 360) . CRC Press . ISBN: 978-1-4822-9786-7 .