Josep Lluis Gelpi Buchaca

Catedrático de Universitat

ORCID: 0000-0002-0566-7723

Scopus Author ID: 35517522400

Researcher ID: M-6401-2013

Área de conocimiento: Bioquímica y Biología Molecular

Grupo de Investigación: MODELITZACIÓ MOLECULAR I BIOINFORMÀTICA

Información de contacto
Departamento de Bioquímica y Biomedicina Molecular
C/Diagonal 643
934034009
gelpi(a)ub.edu

Docencia

Responsable de la linea de Bioinformática en el programa de doctorado de Biomedicina

Miembro de la Comisión Académica del Grado Interuniversitario de Bioinformática

Formación académica

Química . Universidad de Barcelona . 1984 . (Diplomatura / Licenciatura / Grado)

Química . Universitat de Barcelona . 13/07/1990 . (Doctorado)

Lineas de investigación

Desarrollo de metodologías de predicción en el reconocimiento molecular

Metodologías de integración de datos biológicos. Bases de datos biológicas

Desarollo de entornos virtuales de investigación

Evaluación de consecuencias funcionales de variantes de secuencia

Estudio de la regulación alostérica mediante herramientas de simulación

Proyectos

HealthyCloud Health Research & Innovation Cloud (HealthyCloud) . 2021 - 2023 . Ref.965345 . Unió Europea . IP: Karim Lekadir

Training network to advance integrated computational simulations in translational medicine, applied to intervertebral disc degeneration . 2020 - 2024 . Ref.955735 . European Commission . IP: Mariano Vazquez

leveraging the European compute infrastructures for data-intensive research guided by FAIR principles (EuroScienceGateway) . 2022 - 2025 . Ref.101057388 . Unió Europea . IP: Jose Luis Gelpi Buchaca

A European Health Data Toolbox for Enhancing Cardiology Data Interoperability, Reusability and Privacy (DataTools4Heart) . 2022 - 2026 . Ref.101057849 . Unió Europea . IP: Karim Lekadir

European Federation for Cancer Images (EUCAIM) . 2023 - 2026 . Ref.101100633 . Unió Europea . IP: Jose Luis Gelpi Buchaca

Publicaciones en revistas

Hospital, A.; Goñi, R.; Orozco, M.; Gelpí, J.L. (2015). Molecular dynamics simulations: advances and applications. Advances and Applications in Bioinformatics and Chemistry, 8, pp. 37 - 47 . https://doi.org/10.2147/AABC.S70333 . ISSN: 1178-6949

ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Consortium: Campbell, PJ; Getz, G; Korbel, JO; Stuart, JM; Jennings, JL; Stein, LD; [...] Rabionet, R; [...] Gelpi, JL; [...] Aymerich, M; Lopez-Guillermo, A; [...] Campo, E; [...] (2020). Pan-cancer analysis of whole genomes. Nature, 578(7793), pp. 82 - 93 . Repositorio Institucional . ISSN: 0028-0836

Lamprecht, A-L.; Garcia, L.; Kuzak, M.; Martinez, C.; Arcila, R.; Martin Del Pico, E.; Dominguez Del Angel, V.; van de Sandt, S.; Ison, J.; Martinez, P. A.; McQuilton, P.; Valencia, A.; Harrow, J.; Psomopoulos, F.; Gelpi, J.Ll.; Chue Hong, N.; Goble, C.; Capella-Gutierrez, S. (2019). Towards FAIR principles for research software. Data Science . https://doi.org/10.3233/DS-190026 . ISSN: 2451-8484

Buitrago, D.; Codó, L.; Illa, R.; De Jorge, P.; Battistini, F.; Flores, O.; Bayarri, G.; Royo, R.; Del Pino, M.; Heath, S.; Hospital, A.; Gelpí, J.L.; BrunHeath, I.; Orozco, M. (2019). Nucleosome Dynamics: A new tool for the dynamic analysis of nucleosome positioning. Nucleic Acids Research, 47, pp. 9511 - 9523 . Repositorio Institucional . ISSN: 0305-1048

Hospital, A.; Battistini, F.; Soliva, R.; Gelpi, J.L.; Orozco,M. (2019). Surviving the deluge of biosimulation data. WIREs Computational Molecular Science, e1449 . https://doi.org/10.1002/wcms.1449 . ISSN: 1759-0876

Sati, S.; Bonev, B.; Szabo, Q.; Jost, D.; Bensadoun, P.; Serra, F.; Loubiere, V.; Papadopoulos, G.L.; Rivera-Mulia, J.C.; Frisch, L.; Bouret, P.; Castillo, D.; Gelpi, J.L.; Orozco, M.; Vaillant, C.; Pellestor, f.; Bantignies, F.; Marti-Renom, M.A.; Gilbert, D.M.; Lemaitre, J.M. and Cavalli, G. (2020). 4D Genome rewiring during oncogene-induced and replicative senescende. Molecular Cell, 78(3), pp. 522 - 538 . Repositorio Institucional . ISSN: 1097-2765

Bayarri, G.; Andrio, P.; Hospital, A.; Orozco, M. and Gelpi, J.L. (2022). BioExcel Building Blocks REST API (BioBB REST API). Bioinformatics, 38, pp. 3302 - 3303 . https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac316 . ISSN: 1367-4803

Nadeu, F.; Royo, R.; Massoni-Badosa, R.; Playa-Albinyana, H.; Garcia-Torre, B.; Duran-Ferrer, M.; Dawson, K.J.; Kulis, M.; Diaz-Navarro, A.; Villamor, N.; Melero, J.L.; Chapaprieta, V.; Dueso-Barroso, A.; Delgado, J.; Moia, R.; Ruiz-Gil, S.; Marchese, D.; Giró, A.; Verdaguer-Dot, N.; Romo, M.; Clot, G.; Rozman, M.; Frigola, G.; Rivas-Delgado, A.; Baumann, T.; Alcoceba, M.; González, M.; Climent, F.; Abrisqueta, P.; Castellví, J.; Bosch, F.; Aymerich, M.; Enjuanes, A.; Ruiz-Gaspà, S.; López-Guillermo, A.; Jares, P.; Beà, S.; Capella-Gutierrez, S.; Gelpí, J.L.; López-Bigas, N.; Torrents, D.; Campbell, P.J.; Gut, I.; Rossi, D.; Gaidano, G.; Puente, X.S.; Garcia-Roves, P.M.; Colomer, D.; Heyn, H.; Maura, F.; Martín-Subero, J.I.; Campo, E. (2022). Detection of early seeding of Richter transformation in chronic lymphocytic leukemia. Nature Medicine . https://doi.org/10.1038/s41591-022-01927-8 . ISSN: 1078-8956

Bayarri, G.; Andrio, P.; Hospital, A.; Orozco, M. and Gelpí, J.L. (2022). BioExcel Building Blocks Workflows (BioBB-Wfs), an integrated web-based plartform for biomolecular simulations. Nucleic Acids Research, 50(W1), pp. W99 - W107 . Repositorio Institucional . ISSN: 0305-1048

Yakneen, S; Waszak, SM; PCAWG Technical Working Group; Gertz, M; Korbel, JO; PCAWG Consortium (2020). Butler enables rapid cloud-based analysis of thousands of human genomes. Nature Biotechnology, 38, pp. 288 - 292 . Repositorio Institucional . ISSN: 1087-0156

Otras Publicaciones

Sfriso, P.; Emperador, A.; Gelpí, J.L.; Orozco, M. (2014). Discrete Molecular Dynamics . En Computational Approaches to Protein Dynamics: From Quantum to Coarse-Grained Methods . (pp. 339 - 360) . CRC Press . ISBN: 978-1-4822-9786-7 .