Silvia Marin Martinez

Profesora lectora

Researcher ID: C-5492-2017

Área de conocimiento: Bioquímica y Biología Molecular

Grupo de Investigación: Grup de Bioquímica Integrativa

Grupos de Innovación Docente: Metabolisme al grau de Química (QuiMet)

Información de contacto
Departamento de Bioquímica y Biomedicina Molecular
Facultat de Biologia, Departament de Bioquímica i Biologia Molecular; Avda. Diagonal, 645, Edifici Nou, planta -2
934021217
silviamarin(a)ub.edu

Docencia

Docencia de grado (Universitat de Barcelona): Química (grados de Biología y Biotecnología); Biología II - Experimentación química: Laboratorio químico (grados de Biología y Biotecnología); Bioenergética y Transporte (grado de Bioquímica)

Docencia en máster: Computational Systems Biology (máster de Bioinformatics for Health Sciences). Máster interuniversitario UB y UPF. Docencia en inglés

Tutorización Trabajo de Final de Grado (TFG) y Trabajo de Final de Máster (TFM), grados y másters propios de la Universitat de Barcelona

Docencia en cursos de postgrado especializados en el ámbito de la metabolómica y la flujómica

Formación académica

Licenciatura en Química . Universitat de Barcelona . 30/06/1999 . (Diplomatura / Licenciatura / Grado)

Diploma de Estudios Avanzados en Biomedicina . Universitat de Barcelona . 31/07/2001 . (Diplomatura / Licenciatura / Grado)

Doctorado por la Universitat de Barcelona . Universitat de Barcelona . 02/02/2006 . (Doctorado)

Lineas de investigación

METABOLÓMICA Y FLUJÓMICA: Medida de concentración de metabolitos por espectrometria de masas (GC/MS y LC/MS) (MS-based targeted metabolomics). Análisis de la incorporación de 13C en diferentes metabolitos mediante técnicas de metabolómica basada en el uso de trazadores basada en espectrometría de masas (MS-based stable isotope resolved metabolomics). Interpretación de datos de estudios de metabolómica basada en el uso de trazadores. Desarrollo de métodos experimentales y computacionales para metabolómica, metabolómica basada en el uso de trazadores y flujómica. Cuantificación de flujos metabólicos intracelulares a partir de la integración de metabolómica dirigida y de metabolómica basada en el uso de trazadores usando programas informáticos propios. Aplicación de estos análisis a muestras de interés biomédico, biotecnológico o industrial, tanto de tejidos, células o medio de cultivo

TERAPIA DEL CÁNCER (1): Estudio de las diferencias en la regulación del metabolismo energético de líneas celulares tumorales respecto a líneas no tumorales. Caracterización de la reprogramación metabólica asociada a procesos como la metástasis tumoral, el tratamiento farmacológico o el desarrollo de resistencia farmacológica en cáncer. Diseño de nuevas estrategias terapeuticas basadas en impedir la reprogramación metabólica asociada al desarrollo de la metástasis y la quimioresistencia. Identificación de nuevas dianas terapeuticas a partir de estudios de genómica funcional y de metabolómica

TERAPIA DEL CÁNCER (2): Evaluación de nuevos compuestos químicos con potencial actividad antitumoral (compuestos naturales, derivados de compuestos naturales, o compuestos de nueva síntesis) a nivel de: citotoxicidad, ciclo celular, apoptosis y migración celular, entre otros

OTROS: Caracterización de las adaptaciones metabólicas relacionadas con procesos biológicos diversos (más allá del cáncer), como: modelos celulares primarios (hígado y músculo, entre otros), respuesta hormonal, respuesta a la activación de macrófagos, angiogénesis, diferenciación celular (neuronas, músculo, tejido adiposo), sobreexpresión o silenciamiento de proteínas

Proyectos

Identificación de los subtipos metabólicos de cáncer colorrectal para el desarrollo de medicina personalizada . 2021 - 2024 . Ref.PID2020-115051RB-I00 . Ministerio de Ciencia e Innovación (MICINN) . IP: Marta Cascante Serratosa; Pedro Ramon de Atauri Carulla

Tuning Tubulin Dynamics and Interactions to Face Neurotoxicity: a Multidisciplinary Approach for Training and Research (TubInTrain) . 2019 - 2023 . Ref.860070 . Unió Europea . IP: Marta Cascante Serratosa; Silvia Marin Martinez

CENTRO DE INVESTIGACIÓN BIOMÉDICA EN RED (CIBER) . 2018 - 2023 . Ref.CB17/04/00023 . Ministerio de Economia y Competitividad . IP: Marta Cascante Serratosa

Grup de Bioquímica Integrativa . 2017 - 2021 . Ref.2017SGR1033 . Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR) . IP: Marta Cascante Serratosa

Publicaciones en revistas

Polat, Ibrahim H.; Tarrado Castellarnau, Míriam Neus; Benito Mauricio, Adrián; Hernández Carro, Claudia; Centelles Serra, Josep Joan; Marin, Silvia; Cascante i Serratosa, Marta (2021). Glutamine modulates expression and function of glucose 6-phosphate dehydrogenase via NRF2 in colon cancer cells. Antioxidants, 10(9), pp. 1 - 16 . Repositorio Institucional . ISSN: 2076-3921

Karakitsou, E.; Foguet, C.; Contreras Mostazo, M.G.; Kurrle, N.; Schnütgen, F.; Michaelis, M.; Cinatl, J.; Marin, S.; Cascante, M. (2021). Genome-scale integration of transcriptome and metabolome unveils squalene synthase and dihydrofolate reductase as targets against AML cells resistant to chemotherapy. Computational And Structural Biotechnology Journal, 19, pp. 4059 - 4066 . https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.06.049 . ISSN: 2001-0370

Tarragó-Celada,Josep; Foguet,Carles; Tarrado-Castellarnau,Míriam ; Marin, Silvia; Hernández-Alias,Xavier; Perarnau, Jordi; Morrish,Fionnuala; Hockenbery, David; Gomis,Roger R.; Ruppin,Eytan; Yuneva,Mariia; Atauri, Pedro de; Cascante,Marta (2021). Cysteine and Folate metabolism are targetable vulnerabilities of metastatic colorectal cancer. Cancers, 13(3), p. 425 . Repositorio Institucional . ISSN: 2072-6694

Polat IH, Marin S, Ríos J, Larroya M, Sánchez-García AB, Murillo C, Rueda C, Cascante M, Gratacós E, Cobo (2020). Exploratory and confirmatory analysis to investigate the presence of vaginal metabolome expression of microbial invasion of the amniotic cavity in women with preterm labor using high-performance liquid chromatography. American Journal of Obstetrics and Gynecology, 224(1), p. 90 . https://doi.org/10.1016/j.ajog.2020.07.040 . ISSN: 0002-9378

Mostazo, M.G.C.; Kurrle, N.; Casado, M.; Fuhrmann, D.; Alshamleh, I.; Häupl, B.; Martín-Sanz, P.; Brüne, B.; Serve, H.; Schwalbe, H.; Schnütgen, F.; Marin, S.; Cascante, M. (2020). Metabolic plasticity is an essential requirement of acquired tyrosine kinase inhibitor resistance in Chronic myeloid leukemia. Cancers, 12(11)(3443) . Repositorio Institucional . ISSN: 2072-6694

Selivanov, V.A.; Marin, S.; Tarragó-Celada, J.; Lane, A.N.; Higashi, R.M.; Fan, T.W.; de Atauri, P.; Cascante, M. (2020). Software supporting a Workflow of quantitative dynamic flux maps estimation in central metabolism from SIRM experimental data. Methods in Molecular Biology, 2088, pp. 271 - 298 . https://doi.org/10.1007/978-1-0716-0159-4_12 . ISSN: 1940-6029

Balcells, C; Foguet, C; Tarragó-Celada, J; de Atauri, P, Marin, S; Cascante, M (2019). Tracing metabolic fluxes using mass spectrometry: stable isotope-resolved metabolomics in health and disease. Trac-Trends in Analytical Chemistry, 120 . https://doi.org/10.1016/j.trac.2018.12.025 . ISSN: 0165-9936

Foguet, C.; Jayaraman, A.; Marin, S.; Selivanov, V.A.; Moreno,P.; Messeguer, R.; De Atauri, P; Cascante, M. (2019). p13CMFA: Parsimonious 13C metabolic flux analysis. PLoS Computational Biology, 15(9), p. e1007310 . Repositorio Institucional . ISSN: 1553-734X

Alho, D.P.S.; Salvador, J.A.R.; Cascante, M.; Marin, S. (2019). Synthesis and Antiproliferative activity of novel A-ring cleaved glycyrrhetinic acid derivatives. Molecules, 24(16), p. E2938 . Repositorio Institucional . ISSN: 1420-3049

Chong, M.; Jayaraman, A.; Marin, S.; Selivanov, V.; de Atauri Carulla, P.R.; Tennant, D.A.; Cascante, M.; Günther, U.L.; Ludwig, C. (2017). Combined Analysis of NMR and MS Spectra (CANMS). Angewandte Chemie-International Edition, 56(15), pp. 4140 - 4144 . https://doi.org/10.1002/anie.201611634 . ISSN: 1433-7851

Otras Publicaciones

Cascante,M.; Díaz-Moralli,S.; Marín,S. (2009). Metabolómica. Capítulo 4 . En Biotecnología y Biofármacos. Módulo 1. Plan Nacional de Formación Continuada. . (pp. 71 - 89) . BGA Asesores . ISBN: 978-84-692-7025-7 .

Actividades relevantes

Miembro de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular (SEBBM)

Miembro de la Metabolomics Society

Miembro de la Sociedad Española de Metabolómica (SESMET)