Silvia Marin Martinez

Lecturer Professor

Researcher ID: C-5492-2017

Knowledge area: Bioquímica i Biologia Molecular

Research group: Grup de Bioquímica Integrativa

Teaching Innovation Groups: Metabolisme al grau de Química (QuiMet)

Contact Information
Department of Biochemistry and Molecular Biomedicine
Facultat de Biologia, Departament de Bioquímica i Biologia Molecular; Avda. Diagonal, 645, Edifici Nou, planta -2
934021217
silviamarin(a)ub.edu

Teaching

Teaching in University degree (Universitat de Barcelona): Chemistry (degrees of Biology and Biotechnology); Biology II - Chemical laboratory (degrees of Biology and Biotechnology); Bioenergetics and Transport (degree of Biochemistry)

Teaching in Master's degree: Computational Systems Biology (Master in Bioinformatics for Health Sciences). Interuniversity master, between UB and UPF. Teaching in English

Tutoring of Degree Final Work (TFG) and Master Final Work (TFM), University degrees and masters from University of Barcelona

Teaching in specialized postgraduate courses in the field of metabolomics and fluxomics

Academic Training

Licenciatura en Química . Universitat de Barcelona . 30/06/1999 . (Diploma / Degree / Activities)

Diploma de Estudios Avanzados en Biomedicina . Universitat de Barcelona . 31/07/2001 . (Diploma / Degree / Activities)

Doctorado por la Universitat de Barcelona . Universitat de Barcelona . 02/02/2006 . (Ph.D.)

Research interests

METABOLÒMICA I FLUXÒMICA: Mesura de concentració de metabòlits per espectrometria de masses (GC/MS i LC/MS) (MS-based targeted metabolomics). Anàlisi de la incorporació de 13C en diferents metabòlits mitjançant tècniques de metabolòlica basada en l'ús de traçadors basada en espectrometria de masses (MS-based stable isotope resolved metabolomics). Interpretació de dades d'estudis de metabolòmica basada en l'ús de traçadors. Desenvolupament de mètodes experimentals i computacionals per a metabolòmica, metabolòmica basada en l'ús de traçadors i fluxòmica. Quantificació de fluxos metabòlics intracel·lulars a partir de la integració de dades de metabolòmica dirigida i de metabolòmica basada en l'ús de traçadors utilitzant programari propi. Aplicació d'aquests anàlisis en mostres d'interès biomèdic, biotecnològic o industrial, tant de teixits, cèl·lules o medi de cultiu

TERÀPIA DEL CÀNCER (1): Estudi de les diferències en la regulació del metabolisme energètic de línies cel·lulars tumorals respecte a línies no tumorals. Caracterització de la reprogramació metabòlica associada a processos com la metàstasi tumoral, el tractament farmacològic o el desenvolupament de resistència farmacològica en càncer. Diseny de noves estratègies terapèutiques basades en impedir la reprogramació metabòlica associada al desenvolupament de la metàstasi o a la quimioresistència. Identificació de noves dianes terapèutiques a partir dels estudis de genòmica funcional i de metabolòmica

TERÀPIA DEL CÀNCER (2): Avaluació de nous compostos químics amb potencial activitat antitumoral (compostos naturals, derivats de compostos naturals, o compostos de nova síntesi) a nivell de: citotoxicitat, cicle cel·lular, apoptosi i migració cel·lular, entre d'altres

ALTRES: Caracterització de les adaptacions metabòliques relacionades amb processos biològics diversos (més enllà del càncer), com: models cel·lulars primaris (fetge i múscul, entre d'altres), resposta hormonal, resposta a l'activació de macròfags, angiogènesi, diferenciació cel·lular (neurones, múscul, teixit adipòs), sobreexpressió o silenciament de proteïnes

Projects

Identificación de los subtipos metabólicos de cáncer colorrectal para el desarrollo de medicina personalizada . 2021 - 2024 . Ref.PID2020-115051RB-I00 . Ministerio de Ciencia e Innovación (MICINN) . PI: Marta Cascante Serratosa; Pedro Ramon de Atauri Carulla

Tuning Tubulin Dynamics and Interactions to Face Neurotoxicity: a Multidisciplinary Approach for Training and Research (TubInTrain) . 2019 - 2023 . Ref.860070 . Unió Europea . PI: Marta Cascante Serratosa; Silvia Marin Martinez

CENTRO DE INVESTIGACIÓN BIOMÉDICA EN RED (CIBER) . 2018 - 2023 . Ref.CB17/04/00023 . Ministerio de Economia y Competitividad . PI: Marta Cascante Serratosa

Grup de Bioquímica Integrativa . 2017 - 2021 . Ref.2017SGR1033 . Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR) . PI: Marta Cascante Serratosa

Journal Publications

Polat, Ibrahim H.; Tarrado Castellarnau, Míriam Neus; Benito Mauricio, Adrián; Hernández Carro, Claudia; Centelles Serra, Josep Joan; Marin, Silvia; Cascante i Serratosa, Marta (2021). Glutamine modulates expression and function of glucose 6-phosphate dehydrogenase via NRF2 in colon cancer cells. Antioxidants, 10(9), pp. 1 - 16 . Institutional Repository . ISSN: 2076-3921

Karakitsou, E.; Foguet, C.; Contreras Mostazo, M.G.; Kurrle, N.; Schnütgen, F.; Michaelis, M.; Cinatl, J.; Marin, S.; Cascante, M. (2021). Genome-scale integration of transcriptome and metabolome unveils squalene synthase and dihydrofolate reductase as targets against AML cells resistant to chemotherapy. Computational And Structural Biotechnology Journal, 19, pp. 4059 - 4066 . https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.06.049 . ISSN: 2001-0370

Tarragó-Celada,Josep; Foguet,Carles; Tarrado-Castellarnau,Míriam ; Marin, Silvia; Hernández-Alias,Xavier; Perarnau, Jordi; Morrish,Fionnuala; Hockenbery, David; Gomis,Roger R.; Ruppin,Eytan; Yuneva,Mariia; Atauri, Pedro de; Cascante,Marta (2021). Cysteine and Folate metabolism are targetable vulnerabilities of metastatic colorectal cancer. Cancers, 13(3), p. 425 . Institutional Repository . ISSN: 2072-6694

Polat IH, Marin S, Ríos J, Larroya M, Sánchez-García AB, Murillo C, Rueda C, Cascante M, Gratacós E, Cobo (2020). Exploratory and confirmatory analysis to investigate the presence of vaginal metabolome expression of microbial invasion of the amniotic cavity in women with preterm labor using high-performance liquid chromatography. American Journal of Obstetrics and Gynecology, 224(1), p. 90 . https://doi.org/10.1016/j.ajog.2020.07.040 . ISSN: 0002-9378

Mostazo, M.G.C.; Kurrle, N.; Casado, M.; Fuhrmann, D.; Alshamleh, I.; Häupl, B.; Martín-Sanz, P.; Brüne, B.; Serve, H.; Schwalbe, H.; Schnütgen, F.; Marin, S.; Cascante, M. (2020). Metabolic plasticity is an essential requirement of acquired tyrosine kinase inhibitor resistance in Chronic myeloid leukemia. Cancers, 12(11)(3443) . Institutional Repository . ISSN: 2072-6694

Selivanov, V.A.; Marin, S.; Tarragó-Celada, J.; Lane, A.N.; Higashi, R.M.; Fan, T.W.; de Atauri, P.; Cascante, M. (2020). Software supporting a Workflow of quantitative dynamic flux maps estimation in central metabolism from SIRM experimental data. Methods in Molecular Biology, 2088, pp. 271 - 298 . https://doi.org/10.1007/978-1-0716-0159-4_12 . ISSN: 1940-6029

Balcells, C; Foguet, C; Tarragó-Celada, J; de Atauri, P, Marin, S; Cascante, M (2019). Tracing metabolic fluxes using mass spectrometry: stable isotope-resolved metabolomics in health and disease. Trac-Trends in Analytical Chemistry, 120 . https://doi.org/10.1016/j.trac.2018.12.025 . ISSN: 0165-9936

Foguet, C.; Jayaraman, A.; Marin, S.; Selivanov, V.A.; Moreno,P.; Messeguer, R.; De Atauri, P; Cascante, M. (2019). p13CMFA: Parsimonious 13C metabolic flux analysis. PLoS Computational Biology, 15(9), p. e1007310 . Institutional Repository . ISSN: 1553-734X

Alho, D.P.S.; Salvador, J.A.R.; Cascante, M.; Marin, S. (2019). Synthesis and Antiproliferative activity of novel A-ring cleaved glycyrrhetinic acid derivatives. Molecules, 24(16), p. E2938 . Institutional Repository . ISSN: 1420-3049

Chong, M.; Jayaraman, A.; Marin, S.; Selivanov, V.; de Atauri Carulla, P.R.; Tennant, D.A.; Cascante, M.; Günther, U.L.; Ludwig, C. (2017). Combined Analysis of NMR and MS Spectra (CANMS). Angewandte Chemie-International Edition, 56(15), pp. 4140 - 4144 . https://doi.org/10.1002/anie.201611634 . ISSN: 1433-7851

Others Publications

Cascante,M.; Díaz-Moralli,S.; Marín,S. (2009). Metabolómica. Capítulo 4 . In Biotecnología y Biofármacos. Módulo 1. Plan Nacional de Formación Continuada. . (pp. 71 - 89) . BGA Asesores . ISBN: 978-84-692-7025-7 .

Relevant Activities

Miembro de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular (SEBBM)

Miembro de la Metabolomics Society

Membre de la Sociedad Española de Metabolómica (SESMET)