Pedro Ramón de Atauri Carulla

Pedro Ramón de Atauri Carulla

Profesor agregado

ORCID: 0000-0002-7754-7851
Scopus Author ID: 6603151649
Researcher ID: AAG-2384-2020
Área de conocimiento: Bioquímica y Biología Molecular

Grupo de Investigación: Grup de Bioquímica Integrativa

Grupos de Innovación Docente: Metabolisme al grau de Química (QuiMet)

Información de contacto
Departamento de Bioquímica y Biomedicina Molecular
Avinguda Diagonal 643 Edifici Prevosti, Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular (planta -2)
934033747
pde_atauri(a)ub.edu

Docencia

Bioquímica (Grado de Química)
Biologia II (prácticas de laboratorio químico en el Grado de Biotecnologia)
Biología de Sistemas Computacional (master de 'Modelización Computacional Atomística y Multiescala en Física, Química i Bioquímica')
Biología de Sistemas Computacional (master de 'Bioinformàtica para las ciencias de la salud')
Coordinador prácticas de laboratorio químico: Laboratori 1 (Grado Bioquímica), Biologia II (Grados Biotecnologia y Biologia) y Laboratorio e Instrumentación Biomédica (Grado Ciencias Biomédicas)

Formación académica

Ciencias Biológicas . Universidad de Barcelona . 20/07/1990 . (Diplomatura / Licenciatura / Grado)
Ciencias Biológicas . Universidad de Barcelona . 24/07/2001 . (Doctorado)

Lineas de investigación

Biología de Sistemas Computacional (ODE models, Metabolic Control Analysis, 13C Metabolic Flux Analysis, Genome-Scale Metabolic Models)

Publicaciones en revistas

de Atauri, P.; Benito, A.; Vizán, P.; Zanuy, M.; Mangues, R.; Marín, S.; Cascante, M. (2011). Carbon metabolism and the sing of control coefficients in metabolic adaptations underlying K-ras transformation. BBA - Bioenergetics, 1807(6), pp. 746 - 754 . ISSN: 0005-2728
Ramírez-Bajo, M.J.; de Atauri, P.; Ortega, F.; Westerhoff, H.V.; Gelpí, J.L.; Centelles, J.J.; Cascante, M. (2014). Effects of Cadmium and mercury on the upper part of skeletal muscle glycolysis in mice. PLoS One, 9(1), p. e80018 . Repositorio Institucional . ISSN: 1932-6203
de Atauri P.; Tarrado-Castellarnau M.; Tarragó-Celada J.; Foguet C.; Karakitsou E.; Centelles J.J.; Cascante M. (2021). Integrating systemic and molecular levels to infer key drivers sustaining metabolic adaptations. PLoS Computational Biology, 17(7), p. e1009234 . Repositorio Institucional . ISSN: 1553-734X
Través, P.G.; De Atauri, P.; Marín, S.; Pimentel-Santillana, M.; Rodríguez-Prados, J.C.; Marín-de-Mas, I.; Selivanov, V.A.; Martín-Sanz, P.; Boscá, L.; Cascante, M. (2012). Relevance of the MEK/ERK signaling pathway in the metabolism of activated Macrophages: a metabolomic approach. Journal of Immunology, 188(3), pp. 1402 - 1410 . https://doi.org/10.4049/jimmunol.1101781 . ISSN: 0022-1767
Binns, M.; de Atauri, P.; Vlysidis, A.; Cascante, M.; Theodoropoulos, C. (2015). Sampling with poling-based flux balance analysis: optimal versus sub-optimal flux space analysis of Actinobacillus succinogenes. BMC Bioinformatics, 16(49) . Repositorio Institucional . ISSN: 1471-2105
Tényi, Á.; de Atauri, P.; Gomez-Cabrero, D.; Cano, I.; Clarke, K.; Falciani, F.; Cascante, M.; Roca, J.; Maier, D. (2016). ChainRank, a chain prioritisation method for contextualisation of biological networks. BMC Bioinformatics, 17(1), pp. 1 - 17 . Repositorio Institucional . ISSN: 1471-2105
Foguet, C.; Marin, S.; Selivanov, V.A.; Fanchon, E.; Lee, W.N.; Guinovart, J.J.; de Atauri, P.; Cascante, M. (2016). HepatoDyn: a dynamic model of hepatocyte metabolism that integrates 13C isotopomer data. PLoS Computational Biology, 12(4), p. e1004899 . Repositorio Institucional . ISSN: 1553-734X
Tarrado-Castellarnau, M.; de Atauri, P.; Cascante, M. (2016). Oncogenic regulation of tumor metabolic reprogramming. Oncotarget, 7(38), pp. 62726 - 62753 . Repositorio Institucional . ISSN: 1949-2553
Tarrado-Castellarnau, M.; de Atauri, P.; Tarragó-Celada, J.; Perarnau, J.; Yuneva, M.; Thomson T.M.; Cascante, M. (2017). De novo MYC addiction as an adaptive response of cancer cells to CDK4/6 inhibition. Molecular Systems Biology, 13(10), p. 940 . Repositorio Institucional . ISSN: 1744-4292
Foguet, C.; Jayaraman, A.; Marin, S.; Selivanov, V.A.; Moreno,P.; Messeguer, R.; De Atauri, P; Cascante, M. (2019). p13CMFA: Parsimonious 13C metabolic flux analysis. PLoS Computational Biology, 15(9), p. e1007310 . Repositorio Institucional . ISSN: 1553-734X

Otras Publicaciones

Cascante, M.; Benito, A.; Marin de Mas, I.; Centelles, J.J.; Miranda, A.; de Atauri, P. (2014). Chapter 12: Fluxomic . En A systems Biology Approach to Study Metabolic Syndrome. . Volumen. XIX . (pp. 237 - 250) . Springer . ISBN: 978-3-319-01007-6 . http://www.springer.com/978-3-319-01007-6