Josep Francesc Abril Ferrando

Josep Francesc Abril Ferrando

Professor agregat

ORCID: 0000-0001-7793-589X
Scopus Author ID: 7004394733
Researcher ID: B-3877-2014
Àrea de coneixement : Genètica

Grup de Recerca: REGnetREG

Informació de contacte
Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística
Departament Genètica, Microbiologia i Estadística; Facultat Biologia UB; Av Diagonal, 643; Edifici Prevosti; Planta -1; Sala IBUB
934031305
jabril(a)ub.edu

Formació acadèmica

Llicenciat en Ciències Biològiques . Facultat de Biologia, Universitat de Barcelona . 15/07/1998 . (Diplomatura / Llicenciatura / Grau)
Certificació d'Aptitut Pedagògica (CAP) . Facultat de Biologia, Universitat de Barcelona . 30/06/1996 . (Diplomatura / Llicenciatura / Grau)
Diploma d'Estudis Avançats (DEA) . Facultat Ciències Salut i Vida, Universitat Pompeu Fabra . 17/09/2002 . (Diplomatura / Llicenciatura / Grau)
Doctor en Ciències de la Salut i de la Vida . Facultat Ciències Salut i Vida, Universitat Pompeu Fabra . 17/05/2005 . (Doctorat )

Publicacions en revistes

Steijger, T.; Abril, J.F.; Engström, P.G.; Kokocinski, F.; The RGASP Consortium; Hubbard, T.J.; Guigó, R.; Harrow, J.; Bertone, P. (2013). Assessment of transcript reconstruction methods for RNA-seq. Nature Methods, 10(12), pp. 1177 - 1184 . https://doi.org/10.1038/nmeth.2714 . ISSN: 1548-7091
Rodríguez-Esteban, G.; González-Sastre, A.; Ignacio Rojo-Laguna, J.; Saló, E.; Abril, J.F. (2015). Digital gene expression approach over multiple RNA-Seq data sets to detect neoblast transcriptional changes in Schmidtea mediterranea. Bmc Genomics, 16(361) . Repositori Institucional . ISSN: 1471-2164
Castillo, S.; Abril, J.F. (2017). PlanNET: homology-based predicted interactome for multiple planarian transcriptomes. Bioinformatics, 34(6), pp. 1016 - 1023 . Repositori Institucional . ISSN: 1367-4803
Santabárbara-Ruiz, P.; Esteban-Collado, J.; Pérez, L.; Viola, G.; Abril, J.F.; Milán, M.; Corominas, M.; Serras, F. (2019). Ask1 and Akt act synergistically to promote ROS-dependent regeneration in Drosophila. PLoS Genetics, 15(1), p. e1007926 . Repositori Institucional . ISSN: 1553-7390
Arenas-Galnares, R.; Castillo-Lara, S.; Toulis, V.; Boloc, D.; Gonzàlez-Duarte, R.; Marfany, G.; Abril, J.F. (2019). RPGeNet v2 .0: expanding the universe of retinal disease gene interactions network. Database: The Journal of Biological Databases and Curation, 2019 . Repositori Institucional . ISSN: 1758-0463
Castillo-Lara, S.; Pascual-Carreras, E.; Abril, J.F. (2019). PlanExp: intuitive integration of complex RNA-seq datasets with planarian omics resources. Bioinformatics, 36(6), pp. 1889 - 1895 . Repositori Institucional . ISSN: 1367-4803
Martínez-Puchol, S.; Itarte, M.; Rusiñol, M.; Forés, E.; Mejías-Molina, C.; Andrés, C.; Antón, A.; Quer, J.; Abril, J.F.; Girones, R.; Bofill-Mas, S. (2021). Exploring the diversity of coronavirus in sewage during COVID-19 pandemic: Don't miss the forest for the trees. Science of the Total Environment, 800, p. 149562 . Repositori Institucional . ISSN: 0048-9697
Garcia-Giralt, Natalia; Roca-Ayats, Neus; Abril, Josep F.; Martinez-Gil, Nuria; Ovejero, Diana; Castaneda, Santos; Nogues, Xavier; Grinberg, Daniel; Balcells, Susanna; Rabionet, Raquel (2022). Gene Network of Susceptibility to Atypical Femoral Fractures Related to Bisphosphonate Treatment. Genes, 13(1), pp. 1 - 11 . Repositori Institucional . ISSN: 2073-4425
Climent-Cantó, P.; Molnar, C.; Santabárbara-Ruiz, P.; Prieto, C.; Abril, J.F.; Serras, F; Gonzalez, C. (2022). Oxidative Stress Is Associated with Overgrowth in Drosophila l(3)mbt Mutant Imaginal Discs. Cells, 11(16) . Repositori Institucional . ISSN: 2073-4409
Pascual-Carreras, E.; Marín-Barba, M.; Castillo-Lara, S.; Coronel-Córdoba, P.; Magri, M.S.; Wheeler, G.N.; Gómez-Skarmeta, J.L.; Abril, J.F.; Saló, E.; Adell, T. (2023). Wnt/β-catenin signalling is required for pole-specific chromatin remodeling during planarian regeneration. Nature Communications, 14(298), pp. 1 - 16 . Repositori Institucional . ISSN: 2041-1723

Altres Publicacions

Cebrià, F.; Adell, T.; Abril, J.F.; Saló, E. (2011). La regeneració i l'homeòstasi en les planàries, un model clàssic de biologia del desenvolupament . En Organismes model en Biologia (Montserrat Corominas i Marc Valls eds.) . Volum. 62 . (pp. 93 - 106) . Treballs de la Societat Catalana de Biologia. ISSN: 0212-3037 . Publicació Online (http://revistes.iec.cat/index.php/TSCB/article/view/59829/60409)
Blanco, E.; Abril, J.F.; Guigó, R. (2014). Gene-finding related terms and definitions . En Concise Encyclopaedia of Bioinformatics and Computational Biology, 2nd Edition [Zvelebil, M.J. and Hancock, J.M. editors] . Wiley-Blackwell, John Wiley and Sons, Inc. . ISBN: 978-0-470-97871-9 . Publishers' Web Page (http://eu.wiley.com/WileyCDA/WileyTitle/productCd-0470978)
Abril, J.F.; Castellano, S. (2019). Genome Annotation . En Ranganathan, S., Nakai, K., Schönbach C. and Gribskov, M. (eds.), 'Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology' . Volum. 2 . (pp. 195 - 209) . Elsevier Inc. . ISBN: 978-0-12-811432-2 . Abstract Online (https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/B9780128096338202264)

Més Informació: Computational Genomics Lab @ UB (https://compgen.bio.ub.edu/)