XAVIER BARRIL ALONSO. Facultat de Farmàcia i Ciències de l'Alimentació (UB)

Projectes

Interfaces proteína-proteína: un nuevo tipo de diana terapéutica . 2010 - 2012 . Ref.SAF2009-08811 . Ministerio de Ciencia e Innovación (MICINN) . IP: Xavier Barril Alonso

Desarrollo de chaperonas farmacológicas para el tratamiento de enfermedades raras neurometabólicas IPT-2012-0561-010000 (INNPACTO) . 2012 - 2015 . Ref.IPT-2012-0561-010000 . Ministerio de Economia y Competitividad . IP: Xavier Barril Alonso; Rodolfo Lavilla Grifols; Daniel-Raul Grinberg Vaisman

Expandiendo el espacio farmacológico: nuevas herramientas para atacar nuevas dianas terapéuticas . 2013 - 2015 . Ref.SAF2012-33481 . Ministerio de Economia y Competitividad . IP: Xavier Barril Alonso

DIGITAL - DIagnóstico, seGuImiento y Tratamiento de pacientes con enfermedades genéticas incluídas en programas de cribado neonatAL y otras enfermedades raras metabólicas . 2014 - 2016 . Ref.RTC-2014-2412-1 . Ministerio de Economia y Competitividad . IP: Xavier Barril Alonso; Rodolfo Lavilla Grifols

Una nueva plataforma híbrida para generar moleculas-prueba. Aplicación a la Fbw7 E3 ligasa . 2016 - 2018 . Ref.SAF2015-68749-R . Ministerio de Economia y Competitividad . IP: Xavier Barril Alonso

FRAGments training NETwork (FRAGNET) . 2016 - 2020 . Ref.675899 . Unió Europea . IP: Xavier Barril Alonso

Tribbles Research and Innovation Network (TRAIN) . 2019 - 2020 . Ref.721532 . Unió Europea . IP: Xavier Barril Alonso

Network of Functional Molecular Containers with Controlled Switchable Abilities (NOAH) . 2019 - 2022 . Ref.765297 . Unió Europea . IP: Xavier Barril Alonso

Desarrollo de nuevas aproximaciones para el descubirmeinto de moléculas prueba: aplicación a la validación terapeútica de Ligasas E3 para la degradacion de proteínas . 2019 - 2021 . Ref.RTI2018-096429-B-I00 . Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades . IP: Xavier Barril Alonso

Publicacions rellevants

Schmidtke, P.; Luque, F.J.; Murray, J.B.; Barril, X. Shielded hydrogen bonds as structural determinants of binding kinetics. application in drug design. En Journal of the American Chemical Society. Volum 133. Número 46. 2011

Ruiz-Carmona S.; Alvarez-Garcia D.; Foloppe N.; Garmendia-Doval A.B.; Juhos S.; Schmidtke P.; Barril X.; Hubbard R.E.; Morley S.D. rDock: A Fast, Versatile and Open Source Program for Docking Ligands to Proteins and Nucleic Acids. En PLoS Computational Biology. Volum 10. Número 4. 2014 . Repositori Institucional

Alvarez-Garcia, D.; Barril, X. Relationship between protein flexibility and binding: lessons for structure-based drug design. En Journal of Chemical Theory and Computation. Volum 10. Número 6. 2014

Alvarez-Garcia, D.; Barril, X. Molecular simulations with solvent competition quantify water displaceability and provide accurate interaction maps of protein binding sites. En Journal of Medicinal Chemistry. Volum 57. Número 20. 2014 . https://doi.org/10.1021/jm5010418

Ruiz-Carmona, Sergio; Schmidtke, Peter; Luque, F. Javier; Baker, Lisa; Matassova, Natalia; Davis, Ben; Roughley, Stephen; Murray, James; Hubbard, Rod; Barril, Xavier. Dynamic undocking and the quasi-bound state as tools for drug discovery. En Nature Chemistry. Volum 9. Número 3. 2017 . https://doi.org/10.1038/NCHEM.2660

Majewski, M.; Ruiz-Carmona, S.R.; Barril, X. An investigation of structural stability in protein-ligand complexes reveals the balance between order and disorder. En Communications Chemistry. Volum 2. 2019 . Repositori Institucional

Majewski, M.; Barril, X. Structural stability predicts the binding mode of protein-ligand complexes. En Journal of Chemical Information and Modeling. Volum 60. Número 3. 2020 . https://doi.org/10.1021/acs.jcim.9b01062

Sánchez-Cruz, N.; Medina-Franco, J.L.; Mestres, J.; Barril, X. Extended connectivity interaction features: improving binding affinity prediction through chemical description. En Bioinformatics. Volum 37. 2021

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