Xavier Fernandez Cassi

Xavier Fernandez Cassi

Professor lector

ORCID: 0000-0003-2314-9126
Scopus Author ID: 55758574900
Researcher ID: B-9088-2019
Àrea de coneixement : Microbiologia

Grup de Recerca: Virus, bacteris i protozous d'interès en salut pública i seguretat alimentària

Informació de contacte
Departament de Biologia, Sanitat i Medi Ambient
Facultat De Farmàcia i Ciències de la Alimentació, Av. de Joan XXIII, 27-31, 08028, Barcelona Edifici A, Escala E, Soterrani, Despatx 78
669347663
x.fernandez-cassi(a)ub.edu

Formació acadèmica

Llicenciatura en Biologia
Llicenciatura en Ciència i Tecnologia dels Aliments
Màster en Microbiologia Avançada

Línies de recerca

Ús de tècniques de seqüènciació massiva per la detecció d'agents virals causants de gastroenteritis en mostres clíniques sense agent etiològic conegut
Desenvolupament de mètodes moleculars per a la detecció i realització d'estudis epidemiològics, estudi de virus patògens emergents humans
Monitorització del SARS-CoV-2 i les seves variants en aigües residuals per a la realització d'estudis epidemiològics basats en l'ús d'aigües residuals
Millora de les tècniques de seqüenciació massiva aplicada al estudi de virus en mostres ambientals com ara mostres d'aigua i aliments
Avaluació de riscos associats al ús de insectes com a nous productes destinats al consum humà. Estudi dels riscs microbiologics associats al consum d'insectes (grills - Acheta domesticus) destinats al consum humà

Projectes

Development of a measurement method for the detection SARS-CoV-2 RNA in wastewater influent and effluent . 2020 - 2022 . Schweizerische Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung (SNF) . IP: Tamar Kohn; Xavier Fernandez Cassi
Untargeted metaviromics to characterize the infective sewage virome: a step toward to safe potable water reuse . 2018 - 2020 . Ref. 754462 . Curie Co-funding of regional, national and international programmes (COFUND-FP) . IP: Xavier Fernandez Cassi

Publicacions rellevants

Fernandez-Cassi, X.; Silvera, C.; Cervero-Aragó, S.; Rusiñol, M.; Latif-Eugeni, F.; Bruguera-Casamada, C.; Civit, S.; Araujo, R.M.; Figueras, M.J.; Girones, R.; Bofill-Mas, S. Evaluation of the microbiological quality of reclaimed water produced from a lagooning system. En Environmental Science and Pollution Research. Volum 23. 2016 . https://doi.org/10.1007/s11356-016-6812-0
Fernandez-Cassi, Xavier; Martinez-Puchol, Sandra; Silva-Sales, Marcelle; Cornejo, Thais; Bartolome, Rosa; Bofill-Mas, Silvia; Girones, Rosina. Unveiling Viruses Associated with Gastroenteritis Using a Metagenomics Approach. En Viruses. Volum 12. Número 12. 2020 . Repositori Institucional
Fernandez-Cassi, X.; Timoneda, N.; Gonzales-Gustavson, E.; Abril, J. F.; Bofill-Mas, S.; Girones, R. A metagenomic assessment of viral contamination on fresh parsley plants irrigated with fecally tainted river water. En International Journal of Food Microbiology. Volum 257. 2017 . https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2017.06.001
Fernandez-Cassi, X.; Timoneda, N.; Martinez-Puchol, S.; Rusinol, M.; Rodriguez-Manzano, J.; Figuerola, N.; Bofill-Mas, S.; Abril, J. F.; Girones, R. Metagenomics for the study of viruses in urban sewage as a tool for public health surveillance. En Science of the Total Environment. Volum 618. 2018 . Repositori Institucional
Fernandez-Cassi, X.; Scheidegger, A.; Bänziger, C.; Cariti, F.; Tuñas Corzon, A.; Ganesanandamoorthy, P.; Lemaitre, J.C.; Ort, C.; Julian T.R.; Kohn, T. Wastewater monitoring outperforms case numbers as a tool to track COVID-19 incidence dynamics when test positivity rates are high. En Water Research. Volum 200. 2021 . https://doi.org/10.1016/j.watres.2021.117252
Fernandez-Cassi, X.; Söderqvist, K.; Bakeeva, A.; Vaga, M.; Dicksved, J.; Vagsholm, I.; Jansson, A.; Boqvist, S. Microbial communities and food safety aspects of crickets ( Acheta domesticus ) reared under controlled conditions. En Journal Of Insects As Food And Feed. Volum 6. Número 4. 2020 . https://doi.org/10.3920/JIFF2019.0048
Bivins A, North D, Ahmad A, Ahmed W, Alm E, Been F, Bhattacharya P, Bijlsma L, Boehm AB, Brown J, Buttiglieri G, Calabro V, Carducci A, Castiglioni S, Cetecioglu Gurol Z, Chakraborty S, Costa F, Curcio S, de Los Reyes FL 3rd, Delgado Vela J, Farkas K, Fernandez-Casi X, Gerba C, Gerrity D, Girones R, Gonzalez R, Haramoto E, Harris A, Holden PA, Islam MT, Jones DL, Kasprzyk-Hordern B, Kitajima M, Kotlarz N, Kumar M, Kuroda K, La Rosa G, Malpei F, Mautus M, McLellan SL, Medema G, Meschke JS, Mueller J, Newton RJ, Nilsson D, Noble RT, van Nuijs A, Peccia J, Perkins TA, Pickering AJ, Rose J, Sanchez G, Smith A, Stadler L, Stauber C, Thomas K, van der Voorn T, Wigginton K, Zhu K, Bibby K. Wastewater-based epidemiology: global collaborative to maximize contributions in the fight against COVID-19. En Environmental Science & Technology. Volum 54. Número 13. 2020 . https://doi.org/10.1021/acs.est.0c02388
Fernandez-Cassi, X.; Rusiñol, M.; Martínez-Puchol, S. Viral Concentration and Amplification from Human Serum Samples Prior to Application of Next-Generation Sequencing Analysis. En The Human Virome: Methods and Protocols. Volum. 1838 . Springer Science + Business Media. 2018
Cariti, F.; Fernandez-Cassi, X.; Kohn, T. Ultracentrifugation as a tool to concentrate SARS-CoV-2 RNA in wastewater. 2021