Inici UB
Biologia Computacional i Disseny de Fàrmacs

Dades Generals

Adreça Professional: Martí i Franquès, 1 (Barcelona - 08028)

Telèfon: 934021719     Fax: 934021219

Correu-e: fjluque(a)ub.edu

Pàgina Web:

Codis Unesco: Enzimologia / Biomatemàtiques / Biologia molecular (vegeu 2302.21)

Paraules Clau:

Àmbit temàtic: Ciències de la Vida

Equip Investigador

Francisco Javier Luque Garriga fjluque(a)ub.edu

Xavier Barril Alonso xbarril(a)ub.edu

Carles Eduard Curutchet Barat carles.curutchet(a)ub.edu

Carlos Galdeano Cantador cargalcan(a)hotmail.com

Carolina Estarellas Martin cestarellas(a)ub.edu

Axel Bidon-Chanal Badia abidonchanalb(a)ub.edu

Tiziana Ginex tiziana.ginex(a)ub.edu

Josep Maria Campanera Alsina campanera(a)ub.edu

Marta Vila Rigat marta.vila(a)ub.edu

Serena Gaetana Piticchio serena.pit87(a)gmail.com

Scaffidi Salvatore scaffidi.salvatore89(a)gmail.com

Miriam Martinez Cartro miriam.martinez.cartro(a)gmail.com

Antonio Viayna Gaza toniviayna(a)ub.edu

Elnaz Aledavood el.aledavood(a)ub.edu

Javier Vázquez Lozano

William Jesus Zamora Ramirez william.zamora(a)ub.edu

Constanti Seira Castan

Marina Corbella Morato marinacorbella(a)ub.edu

Silvana De Souza Pinheiro

Sergio Ruiz Carmona sruizcarmona(a)gmail.com

Maciej Majewski mmajewski(a)ub.edu

Moira Michelle Rachman moirarachman(a)ub.edu

Christo Christov

Tatyana Karabencheva

Emanuele Fara

Giulia Medici

Publicacions en Revistes

Luque, F.J.; Orozco, M. (1998).  Introduction of polarization in the Generalized Molecular Interaction Potential. Definition of a new Hamiltonian for reactivity studies, and mixed QM/MM calculations. Journal of Computational Chemistry, 19,  866-881.   ISSN: 0192-8651

Orozco, M.; Luque, F. J. (2000).  Theoretical methods for the description of solvent effects on biomolecular systems. Chemical Reviews, 100,  4187-4225.   ISSN: 0009-2665

Forés, M.; Durán, M.; Solà, M.; Orozco, M.; Luque, F.J. (1999).  Theoretical evaluation of solvent effects on the conformational and tautomeric equilibria of 2-(2'-Hydrodyphenyl) benzimidazole and on its absortion and fluorescence spectra. Journal of Physical Chemistry, 103,  4525-4532.   ISSN: 0022-3654

Colominas, C.; Teixidó, J.; Luque, F.J.; Orozco, M. (1999).  Cavitation contribution to the free energy of solvation. Comparison of different formalisms in the context of MST calculations. Chemical Physics, 240,  253-264.   ISSN: 0301-0104

Hernández, B.; Luque, F.J.; Orozco, M. (2000).  Mixed QM/MM molecular electrostatic potentials. Aided Molecular Design, 14(4),  329-339.   ISSN: 0920-654X

Soliva, R.; Luque, F.J.; Alhambra, C.; Orozco, M. (1999).  Role of sugar re-puckering in the transition between A and B forms of DNA in solution. A molecular dynamics study. Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, 17,  89-99.   ISSN: 0739-1102

Soliva, R.; Güimil García, R.; Blas, J.R.; Eritja, R.; Asensio, J.L.; González, C.; Luque, F.J.; Orozco, M. (2000).  DNA-triplex stabilizing properties of 8-aminoguanine. Nucleic Acids Research, 28,  4531-4539.   ISSN: 0305-1048

Cubero, E.; Laughton, C.A.; Luque, F.J.; Orozco, M. (2000).  Molecular dynamics study of oligonucleotides containing difluorotoluene. Journal of the American Chemical Society, 122,  6891-6899.   ISSN: 0002-7863

Cubero, E.; Orozco, M.; Luque, F.J. (1998).  Theoretical study of azidoazomethine-tetrazole isomerism: effect of solventand substituents, and the mechanism of isomerization. Journal of the American Chemical Society, 120,  4723-4731.   ISSN: 0002-7863

Cubero, E.; Sherer, E.C.; Luque, F.J.; Orozco, M.; Laughton, C.A. (1999).  Observation of a spontaneous base pair breathing event in the molecular dynamics simulation of a difluorotoluene-containing DNA oligonucleotide. Journal of the American Chemical Society, 121,  8653-8654.   ISSN: 0002-7863

Hernández, B.; Soliva, R.; Luque, F. J.; Orozco, M. (2000).  Misincorporation of 2'-deoxyoxanosine into DNA.A molecular basis for NO-induced mutagenesis. Nucleic Acids Research, 28,  4873-4883.   ISSN: 0305-1048

Luque, F.J.; López, J.M.; Orozco, M. (2000).  Perspective on `Electrostatic interaction of a solute with a continuum. A direct utilization of a ab initio molecular potentials for the prevision ofsolvent effects´ by S.Miertus, E.Scrocco and J. Tomasi. Theoretical Chemistry Accounts, 103,  343-345.   ISSN: 1432-881X

Cubero, E.; Luque, F.J.; Orozco, M. (1998).  Is polarization important in cation-π interactions ?. PNAS, 95,  5976-5980.   ISSN: 0027-8424

Barril, X.; Muñoz, J.; Luque, F. J.; Orozco, M. (2000).  Simplified descriptions of the topological distribution of hydrophylic/ hydrophobic characteristics of molecules. Physical Chemistry Chemical Physics, 2(21),  4897-4905.   ISSN: 1463-9076

Soliva, R.; Laughton, C.A.; Luque, F.J.; Orozco, M. (1998).  Molecular dynamic simulations in aqueous solution of triple helices containing d(G.C.C) trios. Journal of the American Chemical Society, 120,  11226-11233.   ISSN: 0002-7863

Guardia, E.; Pinzon, R.; Casulleras, J.; Orozco, M.; Luque, F. J. (2001).  A computer simulation study of liquid acetonitrile with ab initio three site potential. Molecular Simulation, 26,  287-306.   ISSN: 0892-7022

De Rosa, M.; Issac, R.P.; Marquez, M.; Orozco, M.; Luque, F.J.; Timken, M.D. (1999).  2-aminopyrrole and simple 1-substitued 2-aminopyrroles: Preparation and ab initio study on the effect of solvent on the amino-imino tautomeric equilibrium. Perkin Transactions 2,  1433-1437.   ISSN: 1472-779X

Cubero, E.; Orozco, M.; Hobza, P.; Luque, F.J. (1999).  Hydrogen bond versus anti-hydrogen bond: A comparative analysis based on the electron density topology. Journal of Physical Chemistry, 103,  6394-6401.   ISSN: 0022-3654

Colominas, C.; Teixidó, J.; Cemelí, J.; Luque, F.J.; Orozco, M. (1998).  Dimerization of carboxylic acids: reliability of theoretical calculations and the effect of solvent. Journal of Physical Chemistry, 102,  2269-2276.   ISSN: 0022-3654

Publicacions en Llibres

Luque, F.J.; Orozco, M. (1998).  Metodologies computacionals per l'estudi de macromolècules. En Cornudella, L. (ed.), Dinàmica estructural de macromolècules, Treballs de la Societat Catalana de Biologia (pp. 73 - 92).

Orozco, M.; Cubero, E.; Barril, X.; Colominas, C.; Luque, F.J. (1999).  Nucleic acid bases in solution. En Computational Molecular Biology. Theoretical Computational Chemistry. J.Leszczynski (ed). Elsevier Science. Chapter 4 (pp. 119 - 166).

Orozco, M.; Cubero, E.; Barril, X.; Colominas, C.; Luque, F.J. (1999).  Nucleic acid bases in solution. En Computational Molecular Biology. Theoretical Computational Chemistry. J.Leszczynski (ed). Elsevier Science. Chapter 4 (pp. 119 - 166).

Luque, F.J.; Orozco, M. (1998).  Metodologies computacionals per a l´estudi de macromolècules. En Publicacions anuals de la Societat Catalana de Biologia L. Cormudella, ed. (pp. 73 - 92).

Orozco, M.; Cubero, E.; Hernandez, B.; Lopez, J. M.; Luque, F. J. (1999).  Interactions of nucleic acid bases: The role of solvent. En Computational Chemistry, Review of Current Trends, Vol. 4, J. Leszczynski (ed.); World Scientific Publishing (pp. 191 - 225).

Muñoz, J.; Barril, X.; Luque, F.J.; Gelpí, J.L.; Orozco, M. (2001).  Partitioning of free energies of salvation into fragment contributions: Applications in drug design. En Fundamentals in Molecular Similarity (pp. 143 - 168).

Trejo, F.; Gelpí, J.L.; Busquets, M.; Cortés, A. (2000).  Use of an engineered His-tag to improve the purification of recombinant wild-type and modified pig heart cytosolic malate dehydrogenase. En Current Topics in Peptide and Protein Research.The Council of Scientific Research Integration (pp. 173 - 180).

Tesis Doctorals i Treballs d'Investigació

Carles Colominas Guardia (1999).  Modelos teóricos para el estudio, de procesos químicos en solución. Ramón Llull. Tesi Doctoral. . 

Presentació de Comunicacions

Trejo, F.; Buquets, M.; Gelpí, J.Ll.; Cortés, A. (1998).  A double amino acid mutation enhances the thermal stability of pig cytosolic malate dehydrogenase. Presentació comunicació,  International Symposium on Stability and Stabilization of Biocatalysts. European Federation of Biotechology, Córdoba, ESPANYA.

Luque, F.J.; Cubero, E.; Gao, J.; Orozco, M. (2000).  Perturbative treatment of polarization effects in Monte Carlo Quantum Mechanical/Molecular Mechanical simulations. Presentació comunicació,  Xth International Congress of Quantum Chemistry, Menton, FRANÇA.

Barril, X.; Gelpi, J. L.; Orozco, M.; Luque, F.J. (2000).  Predicting binding affinties of acetylcholinesterase inhibitor. Comparison of FEP, MD-LRA and PB/SA calculations. Presentació comunicació,  Computational Biophysics 2000, Niza, FRANÇA.

Projectes de Recerca

2000 - 2001.   Ciclo de Conferencias 'Bioinformática 2000'.  (Programa Nacional de Biomedicina).  Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología (CICYT).  Ref.: SAF2000-1917-E.  IP: Modesto Orozco Lopez

2000 - 2002.   Cofinanciación proyecto europeo 'Structural studies on the mechanism of DNAexcision repair'.  (Programa Nacional de Salud).  Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología (CICYT).  Ref.: SAF1999-1824-CE.  IP: Modesto Orozco Lopez

2000 - 2005.   Distinció Científica Jove Investigador..  (Programa Nacional de Promoción General del Conocimiento).  Generalitat de Catalunya.  IP: Modesto Orozco

2000 - 2003.   Simulación de formas inusuales del DNA y de híbridos de ácidos nucleicos. Implicaciones funcionales en el diseño de nuevas terapias.  (Programa Nacional de Promoción General del Conocimiento).  Ministerio de Ciencia y Tecnología.  Ref.: PM99-0046.  IP: Modesto Orozco Lopez

2000 - 2003.   Stuctural studies on the mechanism of DNA excission repair.  (Biomedical sciences and health. BIOMED.).  Unió Europea.  Ref.: QLG1-CT-1999-0008.  IP: M. Sanderson

1999 - 2001.   Estructura y funcion e quinasas celulares bacterianas y viricas de interes medico.  (Programa Nacional de Promoción General del Conocimiento).  Secretaría de Estado de Educación, Universidades, Investigación y Desarrollo.  Ref.: BIO98-1747-CE.  IP: M. Orozco

2000 - 2002.   Structural studies on the mechanism of DNA excision repair..  (Qualitat de vida i gestió dels recursos vius).  Unió Europea.  Ref.: QLG1-CT-1999-00008.  IP: Modesto Orozco Lopez

2000 - 2002.   Reconeixement Molecular.  (Projectes de recerca per potenciar els grups de recerca consolidats ).  Comissionat per a Universitats i Recerca. Generalitat de Catalunya..  Ref.: 1999SGR00324.  IP: Modesto Orozco Lopez
función actividad

1998 - 2000.   Diseño, síntesis y evaluación farmacológica de análogos de la huperzina A como anticolinesterásicos con potencial utilidad en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer.  (Ajuts a la Recerca).  Televisió de Catalunya, S.A (TV3).  IP: F.J. Luque

Contractes

2000 - 2002.   Estudio de formas inusuales del DNA de potencial utilidad terapéutica..  (Programa Nacional de Promoción General del Conocimiento).  Dirección General de Enseñanza Superior e Investigación Científica.  Ref.: 049478/Z/96/Z/JPS/JMW/CE.  IP: Modesto Orozco Lopez

© GREC Curricul@ Grups
Última actualització: 25/09/2018